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+57-6013165000 ext. 16956

CvLac: https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000000053

Google Scholar:

https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=kQCMCFcAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate 

ResearchGate:

https://www.researchgate.net/profile/Marina-Munoz-2

Scopus Author (ID: 57209292845):

https://www.scopus.com/inward/authorDetails.url?authorID=57209292845&partnerID=MN8TOARS 

ORCID:

https://orcid.org/0000-0002-4216-6928 

Áreas de trabajo principales:

Epidemiología molecular; Microbiota; Metagenómica; Resistencia antimicrobiana; One Health; Biotecnología en salud

Formación:

• Bióloga de la Universidad del Tolima
•  
• Maestría en Ciencias - Microbiología de la Universidad Nacional de Colombia
•  
• Doctorado en Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia
•  
• Postdoctorado en Ecología Microbiana en la Universidad del Rosario (Colombia) Postdoctorado en Epidemiología Genómica e Interacciones Hospedero-Microbiota en la Universidad Andrés Bello (Chile).

Líneas de investigación:

• Epidemiología molecular de patógenos.
• Caracterización genómica y fenotípica de bacterias patógenas.
• Ecología microbiana y microbioma en enfermedades infecciosas.
• Resistencia antimicrobiana en enfoque One Health.
• Detección y caracterización de especies clostridiales de importancia en salud.
• Innovación biotecnológica aplicada a la salud.

Grupos de investigación

Grupo interdisciplinario de investigación en: Epidemiología molecular de la infección intrahospitalaria

GrupLac: https://scienti.minciencias.gov.co/gruplac/jsp/visualiza/visualizagr.jsp?nro=00000000000413

Proyectos de los últimos cinco años (Año de inicio):

• Aproximación metagenómica en aguas de consumo urbanas y rurales: una estrategia integral de salud ambiental en el suroccidente colombiano (2024).
• Caracterización integral de bacterias en endocarditis infecciosa de pacientes atendidos en el Hospital Universitario Mayor-Méderi (2024).
• AGORA: Alianza para la Generación de evidencia sobre Covid-19, su Respuesta y lecciones Aprendidas para la postpandemia y futuras epidemias (2023).
• Integración de estrategias de secuenciación de última generación a los esquemas de evaluación de la calidad de agua en Santa Marta (2023).        
• Caracterización del microbioma intestinal de deportistas colombianos pertenecientes a las disciplinas de ciclismo de ruta y levantamiento de pesas: Estudio transversal (2022).
• Desarrollo transferencia de tecnología y conocimiento para la detección caracterización y degradación de SARS-CoV-2 y contaminantes emergentes en aguas residuales urbanas de Pasto, Departamento de Nariño (2022)
• Identificación y caracterización de Clostridium perfringens circulante en humanos, animales y alimentos en el Departamento de Boyacá – Colombia. (2021).
• Caracterización molecular de la microbiota en lesiones de piel de leishmaniasis cutánea localizada en personal del Ejército Nacional procedente de los diferentes departamentos fronterizos y endémicos de Colombia (2021).

Publicaciones destacadas: Años 2025-2024  (iniciando con las más recientes).

Urrea V, Páez-Triana L, Velásquez-Ortiz N, Camargo M, et. al., Metagenomic Analysis of Surface Waters and Wastewater in the Colombian Andean Highlands: Implications for Health and Disease, 2025, Current Microbiology 82 (4), 162. doi: 10.1007/s00284-024-04019-7.        

Camargo M, Vega L, Muñoz M, Hernández-Buelvas L, et. al., Unveiling shifts in cervical microbiota composition among Colombian women in the presence of Trichomonas vaginalis: a longitudinal study, 2025, Parasitology Research 124 (3), 1-7. doi: 10.1007/s00436-025-08482-4    

Páez-Triana L, Martinez D, Patiño LH, et. al., Exploring endosymbionts and pathogens in Rhipicephalus sanguineus and Ctenocephalides felis felis with Oxford Nanopore Technology, 2025, Research in Veterinary Science, 105562. doi: 10.1016/j.rvsc.2025.105562        

Camargo M, Muñoz M, Patiño LH, et. al. Strengthening molecular testing capacity in Colombia: Challenges and opportunities, 2025, Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 116716. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2025.116716        

Gómez M, Martínez D, Luna N, et. al., Comparative analysis of bacterial microbiota in Aedes aegypti (Diptera: Culicidae): insights from field and laboratory populations in Colombia, 2025, Journal of Medical Entomology, tjaf002. doi: 10.1093/jme/tjaf002

Camargo A, Ramírez JD, Kiu R, et. al., Unveiling the pathogenic mechanisms of Clostridium perfringens toxins and virulence factors, 2024, Emerging Microbes & Infections 13 (1), 2341968. doi: 10.1080/22221751.2024.2341968

Urrea V, Castañeda S, Herrera G, et. al., Profiling Unveils the Microbial Composition of Urban River Tributaries: Impact of Human Activities on Water Quality: Urban River Tributaries’ Microbiome, 2024, Inland Waters, 1-18. doi: 10.1080/20442041.2024.2442216

López Y, Galeano K, Faccini-Martínez ÁA, et. al., Rodent group borreliae do occur in wild rodents from the Caribbean region of Colombia, 2024, Parasites & Vectors 17 (1), 494. doi: 10.1186/s13071-024-06560-7

Ramírez AL, Patiño LH, Castañeda SA, et. al., COVID-19 in Latin America: Tracking the SARS-CoV-2 Mu (B. 1.621) Variant: Epidemiology, Genomics, and Vaccine Resistance, 2024, Emerging Viruses in Latin America: Contemporary Virology, 213-224. doi: 10.1007/978-3-031-68419-7_9

Luna N, Páez-Triana L, Ramírez AL, et. al., Microbial community dynamics in blood, faeces and oral secretions of neotropical bats in Casanare, Colombia, 2024, Scientific Reports 14 (1), 25808. doi: 10.1038/s41598-024-77090-6

Bonilla-Aldana JL, Ganem-Galindo NC, Estrada-Cely GE, et. al., Ocular thelaziosis (Thelazia lacrymalis) in a harpy eagle (Harpia harpyja) from Colombia, 2024, New Microbes and New Infections 62, 101512. doi: 10.1016/j.nmni.2024.101512

Donadeu L, Gomez-Olles S, Casanova F, et. al., Role of SARS-CoV-2-specific memory B cells promoting immune protection after booster vaccination in solid organ transplantation, 2024, Frontiers in Immunology 15, 1463769. doi: 10.3389/fimmu.2024.1463769

Camargo A, Páez-Triana L, Camargo D, et. al., Carriage of Clostridium perfringens in domestic and farm animals across the central highlands of Colombia: implications for gut health and zoonotic transmission, 2024, Veterinary Research Communications 48 (4), 2857-2862. doi: 10.1007/s11259-024-10345-9

Medina JE, Castañeda S, Camargo M, et. al., Exploring viral diversity and metagenomics in livestock: insights into disease emergence and spillover risks in cattle, 2024, Veterinary Research Communications 48 (4), 2029-2049. doi: 10.1007/s11259-024-10403-2        

Sandoval-Ramírez CM, Ballesteros N, Pinilla JC, et. al., SARS-CoV-2 Mu variant in dogs visiting veterinary clinics during the third pandemic peak in Eastern Colombia, 2024, Veterinary Research Communications 48 (4), 2657-2662. doi: 10.1007/s11259-024-10374-4

Herrera G, Castañeda S, Arboleda JC, et al., Metagenome-assembled genomes (MAGs) suggest an acetate-driven protective role in gut microbiota disrupted by Clostridioides difficile, 2024, Microbiological Research 285, 127739. doi: 10.1016/j.micres.2024.127739

Camargo A, Bohorquez L, López DP, et. al., Clostridium perfringens in central Colombia: frequency, toxin genes, and risk factors, 2024, Gut Pathogens 16 (1), 32. doi: 10.1186/s13099-024-00629-5

Aya JV, Vega LC, Muñoz E, et. al., Divergent Gut Microbiota: Archaeal and Bacterial Signatures Unveil Unique Patterns in Colombian Cyclists Compared to Weightlifters and Non‐Athletes, 2024, Advanced Biology 8 (6), 2400069. doi: 10.1002/adbi.202400069  

Patiño LH, Ballesteros N, Muñoz M, et. al., Global and genetic diversity of SARS-CoV-2 in wastewater, 2024, Heliyon 10 (5). doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e27452

Jaimes J, Patiño LH, Herrera G, et al., Prokaryotic and eukaryotic skin microbiota modifications triggered by Leishmania infection in localized Cutaneous Leishmaniasis, 2024, PLOS Neglected Tropical Diseases 18 (3), e0012029. doi: 10.1371/journal.pntd.0012029 

Urbano P, Hernández C, Velásquez-Ortiz N, et. al., Transmission ecology of Trypanosoma cruzi by Rhodnius prolixus (Reduviidae: Triatominae) infesting palm-tree species in the Colombian Orinoco, indicates risks to human populations, 2024, PLOS Neglected Tropical Diseases 18 (2), e0011981. doi: 10.1371/journal.pntd.0011981

Gómez M, Martínez D, Páez-Triana L, et. al., Influence of dengue virus serotypes on the abundance of Aedes aegypti insect-specific viruses (ISVs), 2024, Journal of Virology 98 (1), e01507-23. doi: 10.1128/jvi.01507-23

Ramírez AL, Patiño LH, Castañeda SA, et. al., COVID-19 in Latin America: Tracking the SARS-CoV-2 Mu (B. 1.621) Variant: Epidemiology, Genomics, and Vaccine Resistance, 2024, Emerging Viruses in Latin America: Contemporary Virology, 213-224. doi: 10.1007/978-3-031-68419-7_9

Martínez D, Gómez M, Hernández C, et. al., Cryptic transmission and novel introduction of Dengue 1 and 2 genotypes in Colombia, 2024, Virus Evolution 10 (1), veae068. doi: 10.1093/ve/veae068

Medina JE, Castañeda S, Páez-Triana L, et. al., High prevalence of Enterovirus E, Bovine Kobuvirus, and Astrovirus revealed by viral metagenomics in fecal samples from cattle in Central Colombia, 2024, Infection, Genetics and Evolution 117, 105543. doi: 10.1016/j.meegid.2023.105543

Martínez D, Gómez M, Hernández C, et. al, Emergence of dengue virus serotype 2 Cosmopolitan Genotype, Colombia, 2024, Emerging Infectious Diseases 30 (1), 189. doi: 10.3201/eid3001.230972

Jiménez P, Muñoz M, Cruz-Saavedra L, et. al., Blastocystis genetic diversity in animal and human samples from different departments of Colombia using complete sequencing of the 18S rRNA gene (SSU rRNA) by Oxford Nanopore Technologies (ONT), 2024, Acta Tropica 249, 107090. doi: 10.1016/j.actatropica.2023.107090