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Laboratorio de Epidemiología Molecular


 

Laboratorio 454 del Instituto de Biotecnología

 

Objetivos del Laboratorio

 

  • Describir la diversidad genética de microorganismos patógenos, con énfasis en agentes infecciosos de importancia en salud pública.
  • Diseñar, optimizar y validar pruebas moleculares para la detección y caracterización de patógenos en entornos hospitalarios y comunitarios.
  • Analizar la interacción entre microorganismos, hospederos y ambientes para comprender su impacto en la transmisión de enfermedades y resistencia antimicrobiana.

 

Actividades de Investigación

 

Epidemiología  Molecular:  Identificación  y  caracterización  de  patógenos  mediante secuenciación y análisis bioinformático para rastrear su evolución y dispersión.

Caracterización Genómica: Estudio de factores de virulencia y marcadores de resistencia a antibióticos en microorganismos patógenos, mediante secuenciación de genomas completos y análisis comparativo.

Ecología  Microbiana:  Análisis  de  comunidades  microbianas  mediante  secuenciación  de amplicones (metataxonómica) y metagenómica shogun para comprender su rol en la salud de hospederos y ambientes.

 

 

 

Laboratorio de Cultivo de Tejidos Vegetales


 

Laboratorio 450 del Instituto de Biotecnología

 

Objetivos del Laboratorio

 

* Fomentar la investigación participativa e implementar estrategias efectivas de transferencia de tecnología para pequeños productores que favorezcan la conservación de los recursos naturales, la adaptación al cambio climático y la mejora de la calidad de vida de los pequeños productores.

* Emplear herramientas de transformación y edición genética para modificar genes endógenos de cultivos de raíces, con el fin de generar cultivos biotecnológicos que contribuyan a la seguridad alimentaria, la sostenibilidad agrícola y el desarrollo económico del país.

* Conservar y mantener colecciones in vitro de germoplasma de cultivos básicos importantes en la seguridad alimentaria de la región, garantizando su disponibilidad para investigación, mejoramiento genético y producción agrícola.

 

Laboratorio de preparación de medios de cultivo de tejidos vegetales

Funciones del laboratorio: Se realiza la preparación y esterilización de los medios de cultivo usados para crecimiento de plantas en condiciones in-vitro. Está equipado con elementos, equipos e insumos necesarios para la preparación de los medios de cultivo. El laboratorio apoya las actividades de investigación relacionadas con la biotecnología agrícola. Igualmente, apoya las labores de docencia a través de su uso para el desarrollo de cursos en biotecnología agrícola.


Laboratorio de Cultivo de Tejidos Vegetales

Funciones del laboratorio: Este laboratorio cuenta con tres espacios delimitados que son, el área de trabajo, el área de cabinas de flujo laminar y el área de crecimiento vegetal in-vitro. En el primer espacio se realizan labores de preparación de soluciones, electroforesis y post PCR y cuenta con los equipos, reactivos, insumos y materiales necesarios para el desarrollo de investigaciones principalmente en biotecnología agrícola. El área de cabinas de flujo laminar es el espacio aséptico donde se realizan las labores que requieren de esterilidad como la siembra del material vegetal en condiciones in-vitro, siembra de microorganismos, preparación de soluciones para PCR, entre otras. El área de crecimiento de vegetal in-vitro es un cuarto adaptado con condiciones de iluminación y temperatura para el crecimiento de las plantas que se tienen reservadas como banco de germoplasma de proyectos. Este laboratorio está disponible para la ejecución de proyectos de investigación y actividades académicas como el desarrollo de cursos en biotecnología.


Área de cubículos de crecimiento de plantas ex-vitro

Funciones del espacio: área que permite la aclimatación de las plantas que están en condiciones in-vitro para su adaptación a las condiciones ambientales necesarias para su desarrollo en suelo. Espacio compartido con el laboratorio de Microbiología agrícola.

 

 

Laboratorios IBUN


Laboratorio Cultivo de Tejidos Vegetales

Cód. Hermes: 450
Laboratoro Cultivo de Tejidos Vegetales

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Laboratorio de Epidemiología Molecular

Cód. Hermes: 454
Laboratorio de Epidemiología Molecular

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Seminario Ibun - Junio 12  / 2025



 

El Instituto de Biotecnología, tiene el gusto de invitarlos al seminario que presentará el Dr. David Esteban Torres Montañez, sobre “Evaluación fisicoquímica y funcional de un dextrano de origen microbiano”, el jueves 12 de junio a las 8 am en el auditorio del IBUN. El Dr. Torres, es Nutricionista y Dietista de la Universidad Nacional de Colombia, Especialista en Ciencia y Tecnología de Alimentos. Su trabajo de investigación, se enfoca en la aplicación del dextrano en matrices sólidas y líquidas para evaluar sus propiedades funcionales y su capacidad para formar soluciones viscosas, actuar como agente espesante y estabilizante y también por sus propiedades anticoagulantes y su biocompatibilidad..

Agradecemos su participación y la divulgación del seminario. Les recordamos que la conferencia es de una hora y  se podrán unir al seminario por MEET, a través del siguiente enlace:

https://meet.google.com/omx-smif-pne

 

 

Fotografía de Ibonne Aydee García Romero

Ibonne Aydee García Romero

Investigadora PhD.

Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.

+57-6013165000 ext. 16955

Informacion Docente

CvLAC https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000297275

Google académico

https://scholar.google.es/citations?hl=es&user=S7QXgkUAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate

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+57-6013165000 ext. 16955

Áreas de trabajo principales: Fitopatología, microbiología, biología molecular y bioinformática

 

Formación:  Química farmacéutica de la Universidad Nacional de Colombia, Maestría en Ciencias de Microbiología de la Universidad Nacional de Colombia y Doctorado en Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional de Colombia.

 

Líneas de investigación: 

  • Interacción planta – patógeno
  • Ecología microbiana de cultivos agrícolas.
  • Biocontrol.
  • Biología molecular aplicada a biotecnología agrícola 
  • Microbiología.

 

Grupos de investigación. 

  • Bioprocesos y Biopropección – Línea de investigación en caucho natural

         https://scienti.minciencias.gov.co/gruplac/jsp/visualiza/visualizagr.jsp?nro=00000000000401

 

Proyectos recientes: 

  • Poly-inoculum to drench application as control of rice phytopathogen (Pyricularia oryzae, Gaeumannomyces graminis) and its effect on the health plant. 2023/10 – Actual.  Financiado por el ICGEB
  • Promoción de la sostenibilidad en cultivos de importancia económica para el país basada en manejo biológico: arroz y aguacate Hass. 2021/5 – Actual. Financiado por MINCIENCIAS.
  • Exploración de la interacción de los componentes físicos, químicos y biológicos del suelo sobre la productividad del cultivo de arroz bajo agricultura por ambientes 2021/5 - 2024/1. Financiado por la DIB-UNAL.

Publicaciones destacadas: Años:  2025-2020  (iniciando con las más recientes).

  • Palacio Castellanos, A. F., Mora León, Y., Alcántara Cortes, J. S., García Romero, I. A., García Dominguez, C., Cuellar Cuestas, C. I., ... & Aristizábal Gutierrez, F. A. (2023). Quantification of the expression of the amo-A gene in bacterial and archaeal populations present in soil samples from a rice field characterized by environments. Revista Colombiana de Biotecnología, 25(2), 16-32. https://doi.org/10.15446/rev.colomb.biote.v25n2.110118.
  • González-Sayer, S., Oggenfuss, U., García, I., Aristizabal, F., Croll, D., & Riaño-Pachon, D. M. (2022). High-quality genome assembly of Pseudocercospora ulei the main threat to natural rubber trees. Genetics and molecular biology, 45(1), e50510051. https://doi.org/10.1590/1678-4685-GMB-2021-0051
  • Castañeda-Novoa, C. D., Vinchira-Villarraga, D. M., Romero, I. A. G., & Moreno-Sarmiento, N. (2021). Evaluation of the production of antifungal metabolites against Colletotrichum gloeosporioides in Streptomyces 5.1 by random mutagenesis. Acta Scientiarum. Biological Sciences, 43. https://doi.org/10.4025/actascibiolsci.v43i1.54709
  • García Romero, I. A., Garzón, P. A., Méndez Tibambre, M. E., González Peranquive, C. A., Cardozo García, C. F., Peraza Arias, A. R., & Aristizábal Gutiérrez, F. A. (2020). Agronomic evaluation of natural rubber associated with three natural coverages in the altillanura. Colombia Forestal, 23(1), 94-108. https://doi.org/10.14483/2256201x.14996.

GRUPOS DE INVESTIGACIÓN. 

Nombre del Grupo de Investigación: Bioprocesos y Bioprospección

 

Categoría: A (Minciencias Convocatoria 894 de 2021)

 

Líder: Dolly Montoya Castaño

 

Correo: Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.

 

GrupLAC https://scienti.minciencias.gov.co/gruplac/jsp/visualiza/visualizagr.jsp?nro=00000000000401

 

Página Hermes http://www.hermes.unal.edu.co/pages/Consultas/Grupo.jsf?idGrupo=389


Nombre del Grupo: Bioprocesos y bioprospección

 

Inicio: 

El grupo se enfoca en el desarrollo de los bioprocesos, por medio del uso de microorganismos provenientes de la biodiversidad para producir solventes, bioinsumos, biopolímeros y enzimas. Adicionalmente, cuenta con la línea de estudios en caucho natural, focalizada en el estudio de microorganismos patógenos del cultivo del caucho natural y su industria. 

 

Los microorganismos son identificados mediante técnicas fisiológicas y moleculares, y sus genomas, secuenciados, con el fin de establecer la organización de los genes que participan en la actividad biológica buscada. En el caso de los productores de sustancias para la industria se manipulan genéticamente para incrementar la producción de la sustancia deseada. Simultáneamente, se estudian en los microorganismos las características fisiológicas y bioquímicas, con el propósito de producirlos masivamente en reactores y lograr pasar del laboratorio a su elaboración a nivel industrial. 

 

El desarrollo de bioprocesos demanda trabajo interdisciplinario, formación de investigadores y estudiantes de todos los niveles y de diferentes disciplinas en ciencias básicas en armonía con las ingenierías. Seguros de que las buenas ideas plasmadas con calidad en proyectos a largo plazo atraen recursos, se logran alianzas con pares nacionales e internacionales para obtener el capital a fin de cumplir las metas, las cuales exigían desarrollar y dotar los laboratorios necesarios para generar el conocimiento. Cuenta con los laboratorios de fermentaciones, microbiología y caracterización molecular. 

 

Objetivo

 

Generar conocimiento en investigación, desarrollo tecnológico, capacitar recurso humano de alto nivel para el desarrollo tecnológico y negociación de tecnología para proyectarlos al sector productivo. Este esfuerzo involucra el fortalecimiento de una política clara de transferencia de tecnología, incluidas las normas de propiedad intelectual, negociación y apoyo a los organismos estatales para fijar políticas en el área.

 

Integrantes. 

 

Líder del grupo: Dolly Montoya Castaño CvLAC https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000067474

 

Gustavo Buitrago Hurtado CvLAC 

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000051098

 

Nubia Carmenza Moreno Sarmiento CvLAC

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000067482

 

Fabio Ancizar Aristizábal Gutiérrez CvLAC

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000009415

 

Carlos Arturo Martínez Riascos CvLAC 

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000718564

 

Luis Miguel Serrano CvLAC

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001353347

 

José Mauricio Bernal Morales CvLAC

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000281018

 

Ibonne Aydee García Romero CvLAC

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000297275

 

Ivonne del Socorro Gutiérrez Rojas 

https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000141488

 

Líneas de Investigación:

  1. Biopolímeros y Biofertilizantes
  2.  Caracterización Molecular y Bioprospección.
  3. Investigación en Caucho Natural
  4. Tecnología de Enzimas

 

Proyectos de Investigación: (los más recientes de años 2020 a 2025, con enlace a HERMES)

  • Producción de Arthrospira platensis (Espirulina) para alimentación humana como apuesta de crecimiento de la Bioeconomía del Huila: evaluación técnica a escala piloto y prefactibilidad financiera de producción comercial 2023/8 - 2024/8. Financiado por MINCIENCIAS
  • Desarrollo de un proceso para la producción de polihidroxialcanoatos a través de cultivos mixtos y lodos provenientes de plantas de tratamiento de agua residuales. 2022/6 – Actual. Financiado por MINCIENCIAS
  • Poly-inoculum to drench application as control of rice phytopathogen (Pyricularia oryzae, Gaeumannomyces graminis) and its effect on the health plant. 2023/10 – Actual.  Financiado por el ICGEB
  • Investigación y desarrollo: Plataforma público-privada de innovación tecnológica destinada a la producción y a la difusión comercial de inoculantes con mayor eficiencia en condiciones de estrés y con menor emisión de óxido nitroso. 2022/3 – Actual. Financiado por FONTAGRO
  • Promoción de la sostenibilidad en cultivos de importancia económica para el país basada en manejo biológico: arroz y aguacate Hass.2021/5 – Actual. Financiado por MINCIENCIAS
  • Exploración de la interacción de los componentes físicos, químicos y biológicos del suelo sobre la productividad del cultivo de arroz bajo agricultura por ambientes 2021/5 - 2024/1. Financiado por la DIB-UNAL
  • Estrategias biológicas para el manejo nutricional y fitosanitario en cultivos de arroz y aguacate que mejoran la competitividad y sostenibilidad en las cadenas productivas del Tolima 2019/4 - 2020/4. Financiado por el SGR. 



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